Grunnaðferðir við örverugreiningu innihalda eftirfarandi skref:
Sýnataka: Fyrst skal safnað samsvarandi lífsýnum í samræmi við klínísk einkenni og mögulegar smituppsprettur. Við örverufræðilegar prófanir á matvælum þarf að safna dæmigerðum matvælasýnum í samræmi við tilskildar aðferðir og magn. Fylgja skal meginreglunni um smitgát meðan á söfnunarferlinu stendur til að forðast að menga sýnin.
Sýnavinnsla: Söfnuð sýni eru rétt formeðhöndluð, svo sem þynning, styrkur, aðskilnaður, einsleitni, mulning osfrv., til að laga sig að síðari greiningaraðferðum. Til dæmis gæti þurft að mylja kjötsýni í matvælum, gera einsleitt o.s.frv. til að tryggja að örverurnar dreifist jafnt í sýnislausninni.
Val á ræktunarefni: Veldu viðeigandi sértækt ræktunarefni í samræmi við tegund örveru sem á að greina. Til dæmis, við örverufræðilegar prófanir á matvælum, er hentugur ræktunarmiðill valinn í samræmi við tegund örveru sem á að greina.
Sáning og ræktun: Sáð meðhöndlaða sýnið í ræktunarmiðilinn og ræktaðu það við viðeigandi hitastig, rakastig og tímaskilyrði. Í ræktunarferlinu þarf að fylgjast með vexti ræktunarinnar, svo sem formgerð, lit og gagnsæi bakteríanna.
Nýlendaskoðun og talning: Fylgstu með formgerð, lit og öðrum eiginleikum nýlendanna á ræktunarmiðlinum eftir ræktun, teldu þær og auðkenndu þær. Fyrir örverufræðilegar prófanir á matvælum er einnig krafist örverufræðilegrar prófunarskýrslu2.
Túlkun niðurstaðna: Túlkið örveruinnihald sýnisins samkvæmt niðurstöðum prófsins. Fyrir megindlegar prófanir er hægt að reikna út vísbendingar eins og fjölda nýlendna og styrk baktería; fyrir eigindlegar prófanir er hægt að ákvarða hvort sýnið inniheldur ákveðna örveru.
Sérstök notkunarsvið örverugreiningar eru:
Fæðuörverufræðilegar prófanir: Tryggja matvælaöryggi og koma í veg fyrir matareitrun og önnur heilsufarsvandamál. Til dæmis, greina Escherichia coli, Salmonella o.s.frv. í mat.
Umhverfisörverufræðilegar prófanir: Metið hreinlætisaðstæður í umhverfinu og komið í veg fyrir smit sjúkdóma. Til dæmis, greina örverur í lofti og vatnsból á opinberum stöðum eins og sjúkrahúsum og skólum.
Læknissvið: Fylgstu með örverumengun lækningatækja, lyfja osfrv. til að tryggja læknisfræðilegt öryggi.
Með ofangreindum skrefum og ferlum er hægt að klára örverugreiningu kerfisbundið til að tryggja nákvæmni og áreiðanleika niðurstaðna.
